Посмотрите на строку для компоновки и убедитесь, что все нужные библиотеки добавлены в конце. Часто забывают '-ldl' и библиотеки, необходимые для поддержки подключенных баз данных.
Если вы компонуете с Apache 1.2.x, не забыли ли вы добавить соответствующую информацию в строку EXTRA_LIBS в файле Configuration и перезапустить Configure скрипт для Apache.
Некоторые люди также сообщают, что при компоновке с Apache им пришлось добавить '-ldl' сразу после libphp4.a.